Le MP89 possède des intercirculations entre les voitures, ce qui permet d'éviter de devoir descendre du train pour aller d'un bout à l'autre. Il y a deux types d'intercirculations sur les rames CC :
- MF01 (Hübner) : rames 01, 05, 06, 10 à 12, 14, 15, 19, 20, 24, 26, 28, 31, 33, 38, 43 à 50
- MP05 (Paulstra) : rames 02, 03, 04, 07 à 09, 13, 16 à 18, 21, 22, 23, 25, 27, 29, 30, 32, 34 à 37, 39 à 42, 51 et 52
L'intercirculation Sig/Hübner est présente à l'origine sur toutes les rames CC, à l'exception des rames 51 et 52. La CC48 a été la première à avoir été équipée d'intercirculations Hübner en 2005. Les intercirculations Hübner et Paulstra se sont par la suite étendues à l'ensemble des rames CC. La dernière rame à voir perdu ses intercirculations Sig/Hübner est la CC42 courant 2017. La CC01 ne disposait toutefois pas d'intercirculations lors de sa livraison.
Les MP89 CA sont tous équipés d'intercirculations Paulstra.
Pour les rames CC, les sièges sont disposés en 2+1 pour les voitures d'extrêmités et en 2+2 pour les autres voitures, alors que pour les CA, ils sont disposés en 2+1 dans toutes les voitures. Les rames CA possèdent un pupitre de conduite de secours et sont également équipés d'un système de vidéosurveillance permettant au
PCC de la ligne de visualiser ce qui se passe à l'intérieur des rames. On y trouve également des interphones permettant d'entrer en contact avec le PCC en cas de besoin. Le MP89 est également équipé du système
ASA qui consiste en une voix qui annonce le nom des stations au fur et à mesure du parcours. Les rames ne possèdent pas de plan à diodes car ceux-ci sont impossibles à installer du fait que l'éclairage des rames soit situé derrière les plans de lignes. Le MP89 est également le premier matériel où l'ouverture des portes est automatique (auparavant, il fallait appuyer sur un bouton).
Vue sur la voie depuis un MP89 CA
Deux systèmes de fermeture des portes existent pour le MP89 :
- le système Faiveley (vis sans fin) qui équipe toutes les rames CA ainsi que les CC01, 03, 07 à 09, 12 à 14, 18, 20, 24, 25, 28 à 31, 34, 37, 38, 40, 44 et 51
- le système Fersystem (courroie), reconnaissable à son bruit sec lors de l'ouverture des portes et équipe les CC autres que celles citées précédemment.
Pour faciliter la gestion des pièces détachées, les rames équipées du système Faiveley sont les premières à être transférées sur la
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